Holobiont är en kollektiv term för en värdorganism, vanligtvis en eukaryote, och mångfalden av andra arter som lever på, nära eller inom den, gemensamt bildar en ekologisk enhet.

När man tittar på en människa, tänker man på det som en enskild organism från en enda art, men om man zoomar in några miljoner gånger, kommer man att upptäcka att det finns många andra arter som lever på och inuti varje människa. Vi har en hel mikrobiota av bakterier som kan påverka hälsan på vår hud ensam-mer än 500 olika typer! Och på insidan av våra kroppar har vi ytterligare 500-1 000 typer av bakterier i tarmen, tillsammans med de många virus som kan vara närvarande i vårt system, både akuta och asymptomatiska (känd som virome). Det finns också en uppskattad 80 olika släkten av svampar som finns på människokroppen, mestadels på fötterna och mellan tårna!

Det är uppenbart att en människa är intimt kopplad till många andra mikroskopiska arter, varav några är farliga, medan andra är viktiga för att hålla oss friska och balansera vårt mikrobiom. Tillsammans kan människor (som värd) och de många mikroskopiska arterna som lever i och på kroppen (bionts) kallas en holobiont!

Vad är en Holobiont?
Människor kan vara den mest studerade holobionten, men det är säkert inte det enda exemplet. En holobiont är någon agglomerering av en värd, mikrobiom, virom och andra relaterade organismer som varje funktion tillsammans som helhet. För trettio år sedan hade ingen hört talas om en holobiont eftersom termen INTE myntades förrän 1991, av evolutionsteoretikern Lynn Margulis. Det var ursprungligen tillämpas på begränsade partnerskap, såsom olika svampar och alger som kombinerar i lavar täckta stenar, och andra gemensamma symbiotiska relationer, men var snart tillämpas på mycket mer komplexa ekologiska enheter, såsom korallrev!

Ett rev består av själva koralldjuret, algsymbionerna som växer och fungerar på korallen, liksom alla bakteriella och mikrobiella bionter som förlitar sig på dessa andra organismer för att överleva och trivas. Idén om en holobiont har också inspirerat begreppet hologenom, vilket betyder den kollektiva genetiska karaktären hos alla aspekter av en holobiont. Hologenome teorin om evolution ser organismer som samhällen, och deras genetiska kod som en ömsesidigt interagerande och utvecklande genom.

I vissa fall kan detta vara fallet, eftersom symbiotiska relationer ofta resulterar i samevolution, och sådana framsteg kan förekomma i specifika värdbiontpar, men vissa holobionter består av hundratals olika mikroorganismer och arter, som alla interagerar på olika sätt. För tydlighetens skull innehåller en hologenom: 1) värd-och symbiontgener som ensam eller tillsammans påverkar ett holobiontgenom; 2) de samevolved värd-och symbiontgener som påverkar holobiontfenotypen; och 3) värd-och symbiontgener som inte påverkar holobiontfenotypen.

Varje symbiont och biont har en något annorlunda metod för interaktion med värden, allt från parasitisk till mutualistisk, och kan också ha mycket olika nivåer av partnertrohet (som måste vara mycket stark för coevolution). Några av dessa relationer kan vara tillfälliga, eller antagonistiska, eller etablerade i stort sett olika sätt. Tanken att alla dessa enskilda genomer konsekvent kommer att utvecklas som en holobiont enhet är osannolikt; med andra ord, naturligt urval kommer att fungera på olika nivåer, och i olika takt, för ingående medlemmar i holobiont.

Några av de mest studerade exemplen på holobionter är människor och korallrev, men i själva verket är alla djur och växter holobionter, eftersom varje art vi känner till upprätthåller någon form av mikrobiom och nära sammansvetsade relationer med andra mikroorganismer. Under de senaste två decennierna har en betydande mängd forskningsuppmärksamhet skiftat till att studera holobionter och effekterna av sådana komplexa arrangemang på fitness, sjukdom, urval och överlevnad.
Holobiont vs. Symbiote vs. Mikrobiomet vs. Superorganism
Med tanke på att holobiont är ett relativt nytt koncept i biologi är det bara naturligt att vissa människor förvirrar eller förvirrar det med andra relaterade begrepp. Till exempel är ett mikrobiom det kollektiva namnet för de ekologiska samhällen som lever på, i eller nära en organism, inklusive patogena, commensala och symbiotiska partners. Denna term omfattar därför inte själva värden, som vanligtvis är en eukaryotisk organism. En symbiot är en medlem av ett symbiotiskt förhållande, där båda medlemmarna drar nytta av partnerskapet. En holobiont innehåller symbiotiska relationer, men innefattar också parasitiska, opportunistiska, ömsesidiga och commensala partnerskap mellan dussintals eller hundratals konstituerande medlemmar.